La Asamblea Autonómica es el máximo órgano del Sindicato en el ámbito de la Comunidad Autónoma.
Se reúne de forma ordinaria como mínimo una vez entre Congreso y Congreso, y sus funciones son las mismas que tiene el Congreso Estatal, salvo aquellas que excedan del ámbito autonómico. Estas son:
Fijar las líneas básicas de política de acción sindical, política de organización y económica en la autonomía.
Controlar las acciones del Comité ejecutivo Autonómico y restantes órganos autonómicos del Sindicato.
Elegir al secretario o secretaria general autonómico.